Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmlQ9QZD5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmlQ9QZD5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms