Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc4Q9QZD4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms