Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnt3Q9QZ47 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms