Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ndrg3Q9QYF9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndrg3Q9QYF9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms