Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Opn4Q9QXZ9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms