Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copg2Q9QXK3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms