Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChmQ9QXG2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms