Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms