Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfmbt1Q9JMD1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms