Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkap1Q9JMB0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkap1Q9JMB0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkap1Q9JMB0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkap1Q9JMB0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gkap1Q9JMB0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gkap1Q9JMB0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gkap1Q9JMB0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gkap1Q9JMB0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gkap1Q9JMB0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gkap1Q9JMB0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkap1Q9JMB0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms