Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms