Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reep6Q9JM62 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms