Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Rabgef1Q9JM13 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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Rabgef1Q9JM13 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Rabgef1Q9JM13 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
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