Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL0

Crim1, Cysteine-rich motor neuron 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crim1Q9JLL0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crim1Q9JLL0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crim1Q9JLL0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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