Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkd2l2Q9JLG4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms