Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm1Q9JLF6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms