Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace2Q9JL18 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace2Q9JL18 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms