Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms