Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Stx6Q9JKK1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms