Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms