Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms