Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms