Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uchl3Q9JKB1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Uchl3Q9JKB1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Uchl3Q9JKB1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Uchl3Q9JKB1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Uchl3Q9JKB1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Uchl3Q9JKB1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Uchl3Q9JKB1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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