Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnga3Q9JJZ8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnga3Q9JJZ8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnga3Q9JJZ8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga3Q9JJZ8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga3Q9JJZ8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga3Q9JJZ8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga3Q9JJZ8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga3Q9JJZ8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
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