Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd3Q9JJY3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd3Q9JJY3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd3Q9JJY3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd3Q9JJY3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd3Q9JJY3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd3Q9JJY3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd3Q9JJY3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd3Q9JJY3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd3Q9JJY3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms