Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rcl1Q9JJT0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms