Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms