Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1fQ9JIS7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1fQ9JIS7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms