Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgi1Q9JIA1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms