Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LratQ9JI60 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms