Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHX2

Sp5, Transcription factor Sp5, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp5Q9JHX2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sp5Q9JHX2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp5Q9JHX2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp5Q9JHX2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms