Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EefsecQ9JHW4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EefsecQ9JHW4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms