Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hapln2Q9ESM3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hapln2Q9ESM3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms