Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms