Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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DysfQ9ESD7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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DysfQ9ESD7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DysfQ9ESD7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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DysfQ9ESD7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DysfQ9ESD7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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DysfQ9ESD7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DysfQ9ESD7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DysfQ9ESD7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DysfQ9ESD7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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DysfQ9ESD7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DysfQ9ESD7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms