Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ush1cQ9ES64 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms