Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms