Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms