Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr9Q9EQU3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr9Q9EQU3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms