Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox9Q9EQM5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox9Q9EQM5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms