Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndst3Q9EQH7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms