Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cxcr6Q9EQ16 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms