Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS4

Vmn1r172, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r172Q9EPS4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r172Q9EPS4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms