Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl4Q9DCU6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl4Q9DCU6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms