Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xab2Q9DCD2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xab2Q9DCD2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms