Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC3

Ccdc107, Coiled-coil domain-containing protein 107, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc107Q9DCC3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc107Q9DCC3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms