Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde1Q9DBZ9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms