Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc97Q9DBT3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms