Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ftsj3Q9DBE9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ftsj3Q9DBE9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ftsj3Q9DBE9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ftsj3Q9DBE9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ftsj3Q9DBE9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ftsj3Q9DBE9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms