Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkar1aQ9DBC7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms